Принцип работы пипетки Пастера основан главным образом на гравитационном-потоке и капиллярном действии в сочетании с ручным контролем перепада давления воздуха для облегчения аспирации и переноса жидкостей.
Ручной контроль аспирации: оператор осуществляет аспирацию к широкому концу пипетки -либо перорально, либо с помощью вспомогательной резиновой груши-, чтобы создать отрицательное давление внутри трубки, тем самым втягивая жидкость в тонкий наконечник.
Гравитационное-распределение: после прекращения всасывания жидкость вытекает естественным путем под действием силы тяжести; Дозированию также можно способствовать, слегка сжимая корпус пипетки или наклоняя приемный сосуд.
Воспроизводимость капель: калибруя соотношение «капли на миллилитр», пипетка обеспечивает приблизительный количественный перенос, что делает ее подходящей для процедур, требующих повторяемости, а не абсолютной точности.
Гарантия стерильности. Перед использованием в широкий конец можно вставить ватную палочку и простерилизовать, чтобы предотвратить микробное загрязнение во время работы.-Практика, особенно распространенная в микробиологических экспериментах.